サーベイ論文
- 森下 真一 「演繹データベースの問合せ最適化技術」 情報処理, 第36巻, 第6号, 545‐552頁, 1995年6月
- 福田剛志, 森本康彦, 森下真一, 徳山豪 「データマイニングの最新動向 巨大データからの知識発見技術」 情報処理, 第37巻, 第7号, 597‐603頁, 1996年7月
- 森下真一 「情報検索からデータマイニングへ」 電子通信学会誌, Vol.79, No.10, 1996年10月, 1030-1032頁, 1996年10月
- 中谷明弘 森下真一 「ナノレベルのゲノム実験室 ＤＮＡチップによる生体からのゲノム知識発見」 情報処理, 第40巻, 第3号, 320-325頁, 1999年3月
- 森下真一 中谷明弘 「データマイニングの理論と実装」 コンピュータソフトウエア Vol.17, No.1, 59-72 頁, 2000年.
- 森下真一 宮野悟編 「発見科学とデータマイニング」 bit 別冊 320頁，2000年5月
- 森下真一, 本蔵俊彦, 小笠原準 「ヒトゲノム配列へのヒトESTの写像」 実験医学 Vol.19, No.11 （増刊） 2001年
- 森下真一、瀬々潤 「遺伝子発現量解析への情報科学的アプローチ」 蛋白質
核酸 酵素 臨時増刊号「ゲノムサイエンスの新たなる挑戦」 2001年
- 森下真一、小笠原準、本蔵俊彦、山田智之 「ヒトゲノム解読とヒト遺伝子地図の精緻化」情報処理 2002年1月号
- 森下真一、笠原雅弘、佐々木 伸 「ゲノムアセンブラの開発―その技術的･理論的背景」 『蛋白質
核酸 酵素』増刊号 Vol.50, No.16, 2255-2262 (2005)
- 森下真一，中谷洋一郎 「比較ゲノムを支える情報学：脊椎動物ゲノム進化を推定するロジック」細胞工学 Vol.25, No.8 (2006)
- 中谷洋一郎，森下真一 「メダカゲノム解析に基づく脊椎動物ゲノム進化の推定」実験医学増刊号Vol.25 No.2 (2007)
- 森下真一，中谷洋一郎 「比較ゲノムを支える情報学：脊椎動物ゲノム進化を推定するロジック」 細胞工学別冊「比較ゲノム学から読み解く生命システム」 (2007)
- 森下 真一 ／編 阿久津 達也 ／編 実験医学増刊 「生命研究への応用と開発が進むバイオデータベースとソフトウェア最前線」 2008年4月
- バドルルアーサン、山田智之、森下真一 「ゲノムブラウザー」実験医学増刊
「生命研究への応用と開発が進むバイオデータベースとソフトウェア最前線」 (2008)
- 曲薇、 バドルルアーサン、 森下真一 「超高速シークエンサーの原理と情報処理 」実験医学増刊
「生命研究への応用と開発が進むバイオデータベースとソフトウェア最前線」 (2008)
- 森下真一 「次世代シークエンサーを用いたゲノムインフォマティクス」実験医学増刊 Vol.27, No.12 (2009)
- 森下真一 「次世代高速シークエンサーの特性と情報処理」蛋白質核酸酵素 Vol.54, No.10
(2009)
- 森下真一 「生命情報学-ゲノム情報ビッグバンの進展-」情報処理Vol.51 No.6 (2010)